MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia D457

Total Repeats: 108817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017671	CCG	2	6	46	51	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716468
2	NC_017671	TCG	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716468
3	NC_017671	GCT	2	6	177	182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716468
4	NC_017671	CGCGCC	2	12	227	238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716468
5	NC_017671	TCG	2	6	347	352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716468
6	NC_017671	GCA	2	6	359	364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716468
7	NC_017671	GCC	3	9	379	387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716468
8	NC_017671	GCT	3	9	429	437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716468
9	NC_017671	CGC	2	6	477	482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716468
10	NC_017671	TTC	2	6	544	549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716468
11	NC_017671	GAT	2	6	555	560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386716468
12	NC_017671	CAG	2	6	607	612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716468
13	NC_017671	GCT	2	6	621	626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716468
14	NC_017671	TTC	2	6	643	648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716468
15	NC_017671	TTC	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716468
16	NC_017671	GTT	2	6	696	701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386716468
17	NC_017671	AGC	2	6	710	715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716468
18	NC_017671	ATC	2	6	718	723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716468
19	NC_017671	CG	3	6	743	748	0 %	0 %	50 %	50 %	386716468
20	NC_017671	GC	3	6	766	771	0 %	0 %	50 %	50 %	386716468
21	NC_017671	GTCG	2	8	798	805	0 %	25 %	50 %	25 %	386716468
22	NC_017671	CCG	2	6	814	819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716468
23	NC_017671	CGC	2	6	834	839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716468
24	NC_017671	GC	3	6	856	861	0 %	0 %	50 %	50 %	386716468
25	NC_017671	GAT	2	6	883	888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386716468
26	NC_017671	AAG	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716468
27	NC_017671	GC	3	6	941	946	0 %	0 %	50 %	50 %	386716468
28	NC_017671	CCGC	2	8	959	966	0 %	0 %	25 %	75 %	386716468
29	NC_017671	CG	3	6	982	987	0 %	0 %	50 %	50 %	386716468
30	NC_017671	CAC	2	6	990	995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386716468
31	NC_017671	CTG	2	6	1024	1029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716468
32	NC_017671	CAG	3	9	1036	1044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716468
33	NC_017671	ACT	2	6	1082	1087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716468
34	NC_017671	CTG	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716468
35	NC_017671	CGCT	2	8	1129	1136	0 %	25 %	25 %	50 %	386716468
36	NC_017671	CAC	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386716468
37	NC_017671	TGC	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716468
38	NC_017671	TGCC	2	8	1245	1252	0 %	25 %	25 %	50 %	386716468
39	NC_017671	ATG	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386716468
40	NC_017671	GTC	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716469
41	NC_017671	CGC	2	6	1674	1679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716469
42	NC_017671	ACC	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386716469
43	NC_017671	CCCG	2	8	1815	1822	0 %	0 %	25 %	75 %	386716469
44	NC_017671	ATC	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716469
45	NC_017671	CAG	2	6	2046	2051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716469
46	NC_017671	CTA	2	6	2060	2065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716469
47	NC_017671	CTG	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716469
48	NC_017671	GCG	2	6	2092	2097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716469
49	NC_017671	TG	3	6	2140	2145	0 %	50 %	50 %	0 %	386716469
50	NC_017671	ATC	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716469
51	NC_017671	CTG	2	6	2223	2228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716469
52	NC_017671	GCG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716469
53	NC_017671	CGA	2	6	2288	2293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716469
54	NC_017671	GTGAA	2	10	2368	2377	40 %	20 %	40 %	0 %	386716469
55	NC_017671	GC	3	6	2396	2401	0 %	0 %	50 %	50 %	386716469
56	NC_017671	GC	3	6	2411	2416	0 %	0 %	50 %	50 %	386716469
57	NC_017671	GC	3	6	2485	2490	0 %	0 %	50 %	50 %	386716469
58	NC_017671	GAA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716469
59	NC_017671	CTG	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716469
60	NC_017671	CT	3	6	2587	2592	0 %	50 %	0 %	50 %	386716469
61	NC_017671	CTC	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386716469
62	NC_017671	CAG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716469
63	NC_017671	GTG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386716469
64	NC_017671	CCG	2	6	3708	3713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716470
65	NC_017671	CTG	2	6	3778	3783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716470
66	NC_017671	GCCAGG	2	12	3884	3895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386716470
67	NC_017671	AAC	2	6	3926	3931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386716470
68	NC_017671	CGC	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716470
69	NC_017671	CCG	2	6	3951	3956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716470
70	NC_017671	GGCC	2	8	3960	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	386716470
71	NC_017671	GGT	3	9	4090	4098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386716470
72	NC_017671	CGC	2	6	4105	4110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716470
73	NC_017671	CAAG	2	8	4206	4213	50 %	0 %	25 %	25 %	386716470
74	NC_017671	GCA	2	6	4287	4292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716470
75	NC_017671	GCA	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716470
76	NC_017671	GCT	2	6	4416	4421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716470
77	NC_017671	TCGG	2	8	4459	4466	0 %	25 %	50 %	25 %	386716470
78	NC_017671	GGCCA	2	10	4531	4540	20 %	0 %	40 %	40 %	386716470
79	NC_017671	GCCT	2	8	4555	4562	0 %	25 %	25 %	50 %	386716470
80	NC_017671	GCG	2	6	4595	4600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716470
81	NC_017671	CACC	2	8	4647	4654	25 %	0 %	0 %	75 %	386716470
82	NC_017671	TCA	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716470
83	NC_017671	CGG	2	6	4721	4726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716470
84	NC_017671	CGA	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716471
85	NC_017671	AAC	2	6	4934	4939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386716471
86	NC_017671	ACG	2	6	4947	4952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716471
87	NC_017671	CAC	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386716471
88	NC_017671	TCGA	2	8	5072	5079	25 %	25 %	25 %	25 %	386716471
89	NC_017671	GGCC	2	8	5089	5096	0 %	0 %	50 %	50 %	386716471
90	NC_017671	CTCGGT	2	12	5134	5145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716471
91	NC_017671	GTG	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386716471
92	NC_017671	GGC	2	6	5252	5257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716471
93	NC_017671	CGA	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716471
94	NC_017671	CGG	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716471
95	NC_017671	CGGCGT	2	12	5299	5310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386716471
96	NC_017671	GCT	2	6	5338	5343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716471
97	NC_017671	CAG	2	6	5375	5380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716471
98	NC_017671	GCC	2	6	5396	5401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716471
99	NC_017671	ACC	3	9	5426	5434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386716471
100	NC_017671	CAC	2	6	5443	5448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386716471
101	NC_017671	CGC	2	6	5516	5521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716471
102	NC_017671	CGA	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716471
103	NC_017671	CGT	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716471
104	NC_017671	GGC	2	6	5612	5617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716471
105	NC_017671	TCG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716471
106	NC_017671	CAA	2	6	5764	5769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386716471
107	NC_017671	CGG	2	6	5785	5790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716471
108	NC_017671	CACC	2	8	5791	5798	25 %	0 %	0 %	75 %	386716471
109	NC_017671	CAA	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386716471
110	NC_017671	CCAG	2	8	5952	5959	25 %	0 %	25 %	50 %	386716471
111	NC_017671	CGG	2	6	5994	5999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716471
112	NC_017671	GC	4	8	6015	6022	0 %	0 %	50 %	50 %	386716471
113	NC_017671	CGAA	2	8	6048	6055	50 %	0 %	25 %	25 %	386716471
114	NC_017671	TCG	2	6	6078	6083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716471
115	NC_017671	GCG	2	6	6104	6109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716471
116	NC_017671	CGC	2	6	6131	6136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716471
117	NC_017671	GC	3	6	6141	6146	0 %	0 %	50 %	50 %	386716471
118	NC_017671	TCG	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716471
119	NC_017671	CCGCAA	2	12	6259	6270	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386716471
120	NC_017671	TGC	2	6	6282	6287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716471
121	NC_017671	TCC	2	6	6341	6346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386716471
122	NC_017671	ATC	3	9	6431	6439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716471
123	NC_017671	CCGACG	2	12	6444	6455	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386716471
124	NC_017671	CTG	3	9	6479	6487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716471
125	NC_017671	CTT	2	6	6490	6495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716471
126	NC_017671	GCC	2	6	6547	6552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716471
127	NC_017671	GAC	2	6	6596	6601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716471
128	NC_017671	CAG	2	6	6625	6630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716471
129	NC_017671	CGC	2	6	6643	6648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716471
130	NC_017671	GCT	3	9	6700	6708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716471
131	NC_017671	GCC	2	6	6716	6721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716471
132	NC_017671	ATGGAC	2	12	6797	6808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386716471
133	NC_017671	GCGAAG	2	12	6825	6836	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386716471
134	NC_017671	AGG	2	6	6906	6911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386716471
135	NC_017671	GAG	2	6	6917	6922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386716471
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138	NC_017671	TGC	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716471
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155	NC_017671	GCA	2	6	7858	7863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716472
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157	NC_017671	CG	3	6	7940	7945	0 %	0 %	50 %	50 %	386716472
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253	NC_017671	TCG	2	6	11038	11043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716475
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256	NC_017671	GCC	2	6	11074	11079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716475
257	NC_017671	CG	3	6	11083	11088	0 %	0 %	50 %	50 %	386716475
258	NC_017671	TGC	2	6	11190	11195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716475
259	NC_017671	AGC	2	6	11202	11207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386716475
260	NC_017671	CGC	2	6	11226	11231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716475
261	NC_017671	AAG	2	6	11245	11250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386716475
262	NC_017671	TCGCGT	2	12	11259	11270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716475
263	NC_017671	TGC	2	6	11391	11396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716476
264	NC_017671	CGC	2	6	11410	11415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716476
265	NC_017671	TGC	2	6	11416	11421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716476
266	NC_017671	ACC	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386716476
267	NC_017671	TGC	2	6	11520	11525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716476
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270	NC_017671	CGT	2	6	11614	11619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716476
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275	NC_017671	TCG	2	6	11796	11801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716476
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279	NC_017671	CTG	2	6	11900	11905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716476
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282	NC_017671	GGTG	2	8	11986	11993	0 %	25 %	75 %	0 %	386716476
283	NC_017671	TCG	2	6	12024	12029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716476
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285	NC_017671	CTT	2	6	12121	12126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386716476
286	NC_017671	CG	3	6	12138	12143	0 %	0 %	50 %	50 %	386716476
287	NC_017671	AGT	2	6	12222	12227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386716477
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291	NC_017671	TCA	3	9	12304	12312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386716477
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372	NC_017671	GC	3	6	15115	15120	0 %	0 %	50 %	50 %	386716481
373	NC_017671	CCG	2	6	15149	15154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386716481
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379	NC_017671	TGG	2	6	15388	15393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386716481
380	NC_017671	TGTT	2	8	15427	15434	0 %	75 %	25 %	0 %	386716481
381	NC_017671	GCAG	2	8	15458	15465	25 %	0 %	50 %	25 %	386716481
382	NC_017671	GCG	2	6	15522	15527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386716481
383	NC_017671	CGATGC	2	12	15530	15541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386716481
384	NC_017671	CTG	2	6	15562	15567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386716481
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